संस्थान, लगभग सभी प्रमुख कृषि अनुसंधान क्षेत्रों में राष्ट्रीय नेतृत्व को देखते हुए लगभग सभी वार्षिक फसल और बागवानी फसलों के अनुसंधान संस्थानों, केंद्र, परियोजना निदेशालय के साथ निकट संबंध है, समन्वित और साथ ही परियोजनाओं को भारतीय कृषि अनुसंधान परिषद के कुछ चुने हुए संस्थानों. इसी तरह के संबंधों को प्राकृतिक संसाधनों और सामाजिक आर्थिक अनुसंधान संस्थानों के लिए मौजूद हैं. सहयोग के लगभग सभी राज्य कृषि (राज्य कृषि विश्वविद्यालयों) विश्वविद्यालयों, चयनित पारंपरिक विश्वविद्यालयों, सीएसआईआर के संस्थानों और जैव प्रौद्योगिकी विभाग, अंतरिक्ष अनुसंधान, मौसम विज्ञान और सूचना और कई अन्य मंत्रालयों के रूप में विज्ञान के मंत्रालय और प्रौद्योगिकी विभागों के कई के साथ मौजूद है / विभागों भारत सरकार के / संगठन. अंतरराष्ट्रीय स्तर पर, संस्थान CGIAR अंतर्राष्ट्रीय कृषि अनुसंधान केंद्रों में से कई (IARCs) ICRISAT, CIMMYT, IRRI, IFPRI, INSAR, आई आई एम आई, ICARDA और IPGRI और मंत्रिमंडल के साथ और अधिक विशेष रूप से, के साथ निकट संपर्क किया है. अन्य अंतरराष्ट्रीय संगठनों, एफएओ, आईएईए, यूएसएड, यूएनडीपी, WMO, यूनिडो (आईसीजीईबी के माध्यम से) और यूएनईपी के बीच करीबी सहयोगी रहे हैं. कई द्विपक्षीय संबंधों को विकसित और अनुसंधान शामिल विकासशील देशों मौजूद हैं. इन USDA के साथ संपर्क, अमरीका, रॉकफेलर फाउंडेशन, यूरोपीय आयोग, ओडीए, DANIDA, IDRC, सीडा, JAICA, JIRC, CSIRO, ACIAR, MASHAV (इजराइल), IRRDB, AVRDC (ताइवान), आदि में चुनिंदा विश्वविद्यालयों में शामिल हैं